《办法》规定，项目运行管理工作实行“谁审批、谁监管”和“谁建设、谁负责”的原则，明确了项目管理部门和项目运行主体的管理职责；在体系管理上，按照种质资源保护与利用、育种创新、测试评价、良种繁育等4个项目类别，实行体系化挂牌管理，并依托农业农村部建设的项目管理平台，及时调度汇总项目运行管理数据信息，提交项目运行总体状况分析报告；在项目运行管理上，实行项目承担单位法人责任制，要求各单位强化日常管理和运行维护，保障项目持续运行；在绩效评价上，按照项目类别实行分类评价，绩效评价可以采取运行在线监测、现场核查、第三方评价等多种方式，每三年组织一次。强化绩效评价结果运用，将评价结果与支持政策挂钩，并制定了相应奖惩措施。

　　近年来，农业农村部大力推进实施现代种业提升工程，强化种业基础设施建设，改善种业发展条件，提升我国种业自主创新能力和国际竞争力，推动我国由种业大国向种业强国转变。

　　据了解，项目重点支持农业种质资源保护、提升自主创新能力、提升种业综合生产能力等方向，并立足于建设一批标志性的世纪工程，谋划一批重大项目。自现代种业提升工程实施以来，种质资源保护成效显著，国家种质资源保护体系、畜禽遗传资源保护体系初步形成，建成国家级水产原良种场86个，国家级水产种质资源保护区535处，国家级海洋生物种质资源库已启动建设，水产种质遗传资源保护体系进一步完善；育种创新能力显著提升，先后选育推广一批水稻、小麦、玉米、大豆、油菜籽及果菜茶等作物品种。通过国审和省审品种2257个，新品种保护授权数量达1990个，占所有申请新品种保护数量的41％。同时，企业逐步成为育种创新重要主体。畜禽种业方面，形成了以资源场、原种场和扩繁场为基础，质量检测中心、品种性能测定站、遗传评估中心为保障的畜禽良种繁育体系，种畜禽生产水平不断提高。水产种业基本建立了主要养殖品种良种培育技术体系，“十二五”以来，国家审定水产新品种达115个；测试评价水平再上新台阶，初步形成了植物新测试评价体系，年测试品种约2400个，分子测试能力稳步提高。初步具备了对主要畜禽养殖品种进行性能测定和质量检测的能力；农作物种子生产格局持续优化，供种保障基础不断夯实。2019年，杂交水稻制种向闽、湘、苏、川、琼、赣等六省集中，制种面积共计114.57万亩，产量2亿公斤，分别占全国的83.18％和84.04％。杂交玉米种子向甘肃、新疆快速集中，制种面积合计201.88万亩，产量8.35亿公斤，分别占全国的79％和84％；种畜禽产业布局进一步优化，畜禽种业龙头企业不断发展壮大，市场集中度逐步提高，核心育种场良种登记、性能测定等基础性育种工作稳步推进。水产苗种大部分品种基本实现自给。2019年，全国淡水鱼类苗种生产量13000余亿尾，海水鱼类苗种产量120余亿尾，虾苗产量13000余亿尾，贝类苗种约28000亿粒以上；海水养殖的最大品种大黄鱼从濒危物种走上普通百姓餐桌，年育苗量30余亿尾，并通过增殖放流使野生资源得到一定恢复。

　　据统计，“十二五”以来，现代种业提升工程围绕种质资源保护利用、育种创新、测试评价、良种繁育四个关键环节，共安排建设项目1683个，总投资116亿元，中央投资77.2亿元。其中，农作物种业项目842个，总投资66.4亿元，中央投资48.9亿元；畜禽种业项目569个，总投资35.7亿元，中央投资19亿元；水产种业项目272个，总投资近14亿元，中央投资9.3亿元。